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手续费扣款分以下两种情况：
1、卖家没有开通信用卡支付，这种情况下淘宝网信用卡支付的1%手续费从买家支付的金额中扣除。
2、卖家开通有信用卡支付，这种情况下买家在淘宝网可以直接进行信用卡支付，不再支付1%手续费。通过支付宝使用快捷支付、网银等方式进行网购，信用卡和借记卡直接付款均可正常使用。用户在网上购物时可以使用信用卡直接向商户付款，更加方便快捷。
在淘宝网购物，买家使用信用卡支付，扣收的手续费为1%，但是手续费不一定都是由卖家承担的，也可能是由买家承担。使用信用卡付款，关于手续费扣款方的规定如下：如果卖家已开通信用卡支付功能，使用信用卡付款，确认收货时，卖家支付宝收到的款项中扣除1%的手续费。如果卖家未开通信用卡支付功能，使用信用卡付款，买家享有每个月500元/卡的免费额度，免费额度内消费，免收手续费。超出免费额度的消费，如果没有可更换的信用卡进行支付，就会被收取1%的手续费。所以，若在信用卡支付免费额度用完情况下，请选择支付宝或储蓄卡付款，避免产生手续费。
消费者在淘宝网店铺购物时，因部分卖家未开通信用卡支付通道，买家用信用卡付款则需支付1%手续费。不过，消费者在实体店刷信用卡购物支付时，手续费基本是店家承担。
这个1%属于信用卡的费率，不论线上线下，只要用信用卡支付都存在1%手续费，只是部分线下店铺为吸引顾客，选择自己支付这笔费用。
支付宝在页面公告中指出，已经对信用卡还款服务的部分推广规则进行了调整，客户在pc端使用支付宝给他人信用卡还款不再免费，将收取还款金额0.2%/笔的服务费(最少2元/笔，最多25元/笔)。不过，支付宝用户在pc端给自己的信用卡还款仍将继续免费，在手机、pad端使用支付宝手机客户端为信用卡还款，无论给自己还是他人信用卡还款，一律免收手续费。
